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installation_guide_cn.md

File metadata and controls

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安装指引

环境支持

  • 操作系统支持:Windows,Linux 以及 OSX
  • Python 版本:3.6, 3.7

包依赖

名字 版本
numpy -
pandas -
networkx -
paddlepaddle >=2.0.0rc0
pgl >=2.1
rdkit -

(“-” 代表没有版本要求)

安装步骤

因为 PaddleHelix 安装包依赖于最新版的 paddlepaddle(2.0.0rc0 或以上),以及无法直接使用 pip 命令直接安装的 rdkit,因此我们建议创建一个新的 conda 环境,具体步骤如下:

  1. 如果你之前从来没有使用过 conda,可以参考这个网页来安装 conda:

    https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/install/

  2. 在安装完 conda 之后, 可以开始创建一个新的 conda 环境:

conda create -n paddlehelix python=3.7
  1. 使用如下命令激活 conda 环境:
conda activate paddlehelix
  1. 在安装 PaddleHelix 之前,首先需要使用 conda 安装 rdkit
conda install -c conda-forge rdkit
  1. 基于你想在 CPU 或者 GPU 上运行 PaddleHelix 来选择安装不同版本的 paddlepaddle:

    比如,你想使用 paddlepaddle 的 GPU 版本,你可以运行以下命令:

    python -m pip install paddlepaddle-gpu -f https://paddlepaddle.org.cn/whl/stable.html

    或者你想使用 paddlepaddle 的 CPU 版本,你可以运行以下命令:

    python -m pip install paddlepaddle -i https://mirror.baidu.com/pypi/simple

    请注意安装 paddlepaddle 2.0 以上版本,其他安装方法参见 paddlepaddle 官方文档

  2. 使用 pip 命令安装PGL:

pip install pgl
  1. 使用 pip 命令安装 PaddleHelix
pip install paddlehelix
  1. 等待 PaddleHelix 安装完成!

注意

运行完项目之后,如果想要退出当前 conda 环境,可以使用下列命令:

conda deactivate