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1.如图所示,假如我想对每个样本(时间点1,时间点2,时间点3等。。多个单细胞样本,同一种细胞类型)进行热图绘制,请问这样的做法是可行的吗? 因为我看你的GitHub所给的参考示例,是使用单一样本,多个细胞类型进行热图绘制的,所以我想尝试把列换成样本,然后选择统一的细胞类型进行一个热图聚类。
2.另外我还想问一个问题,这个热图的每一列代表一个细胞类型,每行代表一个基因,请问这个数值是scale data吗?还是说,这个是每个细胞在这个基因中的mean值?
The text was updated successfully, but these errors were encountered:
最后补充一点,非常感谢作者提供的代码。
Sorry, something went wrong.
问题1:没什么问题,是可行的。问题2:seurat里有个对所有细胞取均值的函数,差不多就是该类型所有细胞均值表达量。
谢谢你的回复
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1.如图所示,假如我想对每个样本(时间点1,时间点2,时间点3等。。多个单细胞样本,同一种细胞类型)进行热图绘制,请问这样的做法是可行的吗?
因为我看你的GitHub所给的参考示例,是使用单一样本,多个细胞类型进行热图绘制的,所以我想尝试把列换成样本,然后选择统一的细胞类型进行一个热图聚类。
2.另外我还想问一个问题,这个热图的每一列代表一个细胞类型,每行代表一个基因,请问这个数值是scale data吗?还是说,这个是每个细胞在这个基因中的mean值?
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